Dans l'Ouest aride, El Topo fut un bandit qui, ouvrant les portes de son coeur, devint un saint à même d'accomplir de grands miracles.
De deux femmes différentes, il eut deux fils.
Funeste silhouette de cuir noir arpentant le désert, Caïn le maudit s'est juré de tuer ce père à qui il n'a jamais pardonné. Incapable d'accomplir sa soif de vengeance, il décide alors de jeter son dévolu sur son demi-frère Abel. Et dans cet ouest sauvage empreint de mysticisme, ceux qui croiseront sa route en seront les victimes collatérales.